A 30 éves sztár az Ajax ificsapatánál kezdte pályafutását, majd 2003-ig a felnőttcsapatot erősítette, 90 mérkőzésen 18 gólt szerzett. Legnagyobb sikereit is itt érte el, két holland bajnoki címet és három holland kupát nyert nevelőegyüttesével.
2003 és 2005 között játszott az Interben, de nagy melléfogásnak bizonyult leigazolása, harminc mérkőzésen mindössze egy találat a mérlege. Ezután a Premier League-ben próbált szerencsét, de négy szezon alatt mindössze húszszor játszott, sérülések, alkoholproblémák, fegyelmezetlenség nehezítette érvényesülését.
Andy Van der Meyde a szezon végéig írt alá a holland klubhoz, amit kölcsönös megelégedés esetén további két évvel meghosszabbítanak.